扣缴个人所得税零申报与正常申报一样，没有区别。

所谓零申报是说扣缴的个人所得税是零（不需要交税）。金税三期需要企业要填写全员全额个人所得税纳税申报表，有工资，达不到纳税标准的不用纳税。

一、免税所得是指《中华人民共和国个人所得税法》第四条规定可以免税的所得。 税法第四条具体规定如下： 

1、省级人民政府、国务院部委和中国人民解放军军以上单位，以及外国组织、国际组织颁发的科学、教育、技术、文化、卫生、体育、环境保护等方面的奖金。　

2、国债和国家发行的金融债券利息。　

3、按照国家统一规定发给的补贴津贴。 　　

4、福利费、抚恤金、救济金。　

5、保险赔款。 　　

6、军人的转业费、复员费。　　

7、按照国家统一规定发给干部、职工的安家费、退职费、退休工资、离休工资、离休生活补助费。　

8、依照我国有关法律规定应予免税的各国驻华使馆、领事馆的外交代表、领事官员和其他人员的所得。　　

9、中国政府参加的国际公约、签订的协议中规定免税的所得。　　

10、经国务院财政部门批准免税的所得。　　

二、“减除费用”是指税法第六条规定可以在税前减除的费用。 税法第六条具体规定应纳税所得额的计算：

1、工资、薪金所得，以每月收入额减除费用三千五百元后的余额，为应纳税所得额。 　　

2、劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得、财产租赁所得，每次收入不超过四千元的，减除费用八百元。四千元以上的，减除百分之二十的费用，其余额为应纳税所得额。

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